Основана Крымская астрофизическая обсерватория в начале XX века на горе Кошка возле курортного поселка Симеиз. Изначально это была частная обсерватория довольно богатого любителя астрономии Николая Мальцева. Черз несколько лет в 1912 году обсерватория была передана в дар Пулковской обсерватории и была преобразована в настоящий научный центр. В 1926 гду обсерватория на горе Кошка был установлен самый крупный на те дни в Европе метровый рефлектор поризводства Англии. Обсерватория занималась фотометрией звезд и малых планет.
Во времена Великой отечественной войны Крымская астрофизическая обсерватория была полностью разрушена. Но советское правительство начало восстановление обсерватории сражу же по окончанию ВОВ, но уже на новом сесте в центральном Крыму. Новая астрофизическая обсерватория и поселок Научное расположились в Бахчисарайском районе, где климат более подходит для установки больших телескопов.
Первыми телескопами КрАО стали 48-дюймовый рефлектор и двойной 16-ти дюймовый рефрактор-астрограф, полученные по репарации из Германии (фирма Карл Цейс). Постоянные наблюдения начались в начале 50х годов.
Сегодня это один из крупнейших научно-исследовательских институтов СНГ. Также из года в год возрастает интерес отечественных и зарубежных туристов к научному городку. Тем более, что обсерваторию окружает масса историко-культурных памятников Второй гряды Крымских гор ("пещерные города", Ханский дворец, Большой каньон Крыма и др.).